朱元璋对马皇后相当宽容，这一方面是因为马皇后是他最爱的女人之一，另一方面也是因为她在政治上的重要性。马皇后是朱元璋的贵妃之一，也是他的正妻之一，两人有过多年的感情基础，朱元璋非常珍视她。此外，马皇后也在政治上扮演着重要的角色。她出身贵族，有许多势力和背景，可以帮助朱元璋巩固统治地位，同时也可以作为平息各种内乱和争斗的调停者。
至于朱元璋为什么叫马皇后妹子，其实这是明代官员的一种称呼方式，不一定要按照亲戚关系来称呼。马皇后在宫中地位高，又比较亲近朱元璋，所以他可能就用这个称呼方式来表示亲近和尊重。另外，当时的宫廷中还有许多其他的称呼方式，比如妃子、娘娘、皇后等，都是根据各自的地位和关系来称呼的。